Protein–RNA interactions for Protein: Q62388

Atm, Serine-protein kinase ATM, mousemouse

Predictions only

Length 3,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtmQ62388 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
AtmQ62388 Map1lc3b-205ENSMUST00000181948 766 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
AtmQ62388 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
AtmQ62388 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
AtmQ62388 Gm43777-201ENSMUST00000197269 376 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
AtmQ62388 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
AtmQ62388 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
AtmQ62388 Krtap12-1-201ENSMUST00000092370 656 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
AtmQ62388 Krtap3-3-201ENSMUST00000092700 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
AtmQ62388 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
AtmQ62388 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
AtmQ62388 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
AtmQ62388 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
AtmQ62388 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
AtmQ62388 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
AtmQ62388 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
AtmQ62388 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
AtmQ62388 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
AtmQ62388 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
AtmQ62388 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
AtmQ62388 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
AtmQ62388 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
AtmQ62388 Tmem181c-ps-201ENSMUST00000115772 1288 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
AtmQ62388 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
AtmQ62388 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
AtmQ62388 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
AtmQ62388 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
AtmQ62388 Gm37851-201ENSMUST00000193871 889 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
AtmQ62388 Gm39091-201ENSMUST00000206189 553 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
AtmQ62388 AC122860.1-201ENSMUST00000217669 773 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
AtmQ62388 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
AtmQ62388 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
AtmQ62388 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
AtmQ62388 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
AtmQ62388 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
AtmQ62388 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
AtmQ62388 Hmox1-201ENSMUST00000005548 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
AtmQ62388 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
AtmQ62388 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
AtmQ62388 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
AtmQ62388 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Gm23769-201ENSMUST00000104441 121 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Gm12345-201ENSMUST00000119288 898 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Rrm2b-207ENSMUST00000146821 420 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Kcne3-206ENSMUST00000207995 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Cryab-205ENSMUST00000216755 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
AtmQ62388 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Gzmk-201ENSMUST00000038212 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Pgk1-rs7-201ENSMUST00000085735 1255 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
AtmQ62388 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Ube2d-ps-201ENSMUST00000121354 441 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Gm12668-201ENSMUST00000134966 575 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
AtmQ62388 2610016A17Rik-201ENSMUST00000185211 474 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Tmprss11c-202ENSMUST00000196462 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Gm9644-201ENSMUST00000212828 1183 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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AtmQ62388 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
AtmQ62388 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Gm7627-201ENSMUST00000183205 999 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Ighv1-70-201ENSMUST00000196509 351 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
AtmQ62388 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AtmQ62388 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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