Protein–RNA interactions for Protein: Q61635

Ifi47, GTP-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi47Q61635 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ifi47Q61635 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms