Protein–RNA interactions for Protein: Q61602

Gli3, Transcriptional activator GLI3, mousemouse

Predictions only

Length 1,583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli3Q61602 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
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Gli3Q61602 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gli3Q61602 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gli3Q61602 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gli3Q61602 Gm13412-201ENSMUST00000150621 677 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gli3Q61602 Gm4858-201ENSMUST00000179064 735 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gli3Q61602 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gli3Q61602 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gli3Q61602 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gli3Q61602 CT025618.1-201ENSMUST00000227409 1279 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gli3Q61602 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gli3Q61602 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gli3Q61602 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gli3Q61602 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gli3Q61602 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gli3Q61602 Hsf2-204ENSMUST00000220042 2430 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gli3Q61602 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gli3Q61602 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gli3Q61602 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gli3Q61602 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gli3Q61602 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gli3Q61602 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gli3Q61602 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gli3Q61602 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gli3Q61602 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gli3Q61602 Zc2hc1a-203ENSMUST00000193010 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gli3Q61602 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gli3Q61602 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gli3Q61602 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gli3Q61602 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gli3Q61602 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gli3Q61602 Capns1-202ENSMUST00000108196 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gli3Q61602 Mir1249-201ENSMUST00000116791 98 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gli3Q61602 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gli3Q61602 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gli3Q61602 Milr1-206ENSMUST00000182896 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gli3Q61602 Milr1-207ENSMUST00000182908 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gli3Q61602 Mir7088-201ENSMUST00000184227 86 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gli3Q61602 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gli3Q61602 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gli3Q61602 Ngp-201ENSMUST00000035061 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gli3Q61602 Cxcl10-201ENSMUST00000038816 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gli3Q61602 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gli3Q61602 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gli3Q61602 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Gli3Q61602 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gli3Q61602 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gli3Q61602 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gli3Q61602 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gli3Q61602 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gli3Q61602 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gli3Q61602 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Gli3Q61602 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gli3Q61602 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Gli3Q61602 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gli3Q61602 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Gli3Q61602 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gli3Q61602 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Gli3Q61602 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gli3Q61602 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Gli3Q61602 Sh3gl2-202ENSMUST00000107184 671 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Gli3Q61602 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Gli3Q61602 Tpd52l1-204ENSMUST00000214644 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gli3Q61602 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gli3Q61602 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gli3Q61602 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gli3Q61602 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gli3Q61602 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gli3Q61602 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gli3Q61602 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gli3Q61602 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gli3Q61602 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gli3Q61602 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gli3Q61602 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gli3Q61602 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gli3Q61602 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gli3Q61602 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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