Protein–RNA interactions for Protein: Q61510

Trim25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim25Q61510 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim25Q61510 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim25Q61510 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim25Q61510 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim25Q61510 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim25Q61510 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim25Q61510 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim25Q61510 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim25Q61510 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim25Q61510 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim25Q61510 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim25Q61510 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim25Q61510 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim25Q61510 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim25Q61510 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim25Q61510 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim25Q61510 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim25Q61510 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim25Q61510 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim25Q61510 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim25Q61510 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim25Q61510 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim25Q61510 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim25Q61510 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim25Q61510 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim25Q61510 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim25Q61510 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim25Q61510 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim25Q61510 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim25Q61510 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim25Q61510 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim25Q61510 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim25Q61510 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim25Q61510 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim25Q61510 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim25Q61510 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim25Q61510 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim25Q61510 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim25Q61510 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim25Q61510 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim25Q61510 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim25Q61510 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim25Q61510 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim25Q61510 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim25Q61510 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim25Q61510 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim25Q61510 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim25Q61510 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim25Q61510 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim25Q61510 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim25Q61510 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim25Q61510 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim25Q61510 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim25Q61510 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim25Q61510 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim25Q61510 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim25Q61510 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim25Q61510 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim25Q61510 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim25Q61510 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim25Q61510 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim25Q61510 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim25Q61510 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim25Q61510 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim25Q61510 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim25Q61510 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim25Q61510 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim25Q61510 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim25Q61510 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim25Q61510 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim25Q61510 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim25Q61510 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim25Q61510 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim25Q61510 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim25Q61510 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim25Q61510 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim25Q61510 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim25Q61510 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim25Q61510 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim25Q61510 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim25Q61510 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim25Q61510 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim25Q61510 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim25Q61510 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim25Q61510 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim25Q61510 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim25Q61510 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trim25Q61510 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trim25Q61510 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trim25Q61510 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trim25Q61510 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trim25Q61510 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trim25Q61510 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trim25Q61510 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trim25Q61510 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trim25Q61510 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim25Q61510 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim25Q61510 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim25Q61510 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim25Q61510 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms