Protein–RNA interactions for Protein: Q61457

Ccne1, G1/S-specific cyclin-E1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne1Q61457 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccne1Q61457 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccne1Q61457 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccne1Q61457 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccne1Q61457 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccne1Q61457 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccne1Q61457 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccne1Q61457 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccne1Q61457 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccne1Q61457 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccne1Q61457 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccne1Q61457 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccne1Q61457 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccne1Q61457 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccne1Q61457 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccne1Q61457 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccne1Q61457 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccne1Q61457 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccne1Q61457 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccne1Q61457 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccne1Q61457 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccne1Q61457 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccne1Q61457 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccne1Q61457 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccne1Q61457 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccne1Q61457 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccne1Q61457 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccne1Q61457 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccne1Q61457 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccne1Q61457 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccne1Q61457 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccne1Q61457 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccne1Q61457 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccne1Q61457 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccne1Q61457 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccne1Q61457 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccne1Q61457 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccne1Q61457 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccne1Q61457 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
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Ccne1Q61457 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
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Ccne1Q61457 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccne1Q61457 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Ccne1Q61457 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Ccne1Q61457 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccne1Q61457 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccne1Q61457 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccne1Q61457 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccne1Q61457 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccne1Q61457 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccne1Q61457 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccne1Q61457 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccne1Q61457 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccne1Q61457 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccne1Q61457 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccne1Q61457 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccne1Q61457 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Ccne1Q61457 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Ccne1Q61457 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccne1Q61457 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccne1Q61457 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Ccne1Q61457 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Ccne1Q61457 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccne1Q61457 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccne1Q61457 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccne1Q61457 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Ccne1Q61457 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccne1Q61457 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccne1Q61457 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccne1Q61457 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccne1Q61457 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccne1Q61457 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccne1Q61457 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccne1Q61457 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccne1Q61457 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccne1Q61457 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccne1Q61457 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccne1Q61457 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccne1Q61457 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccne1Q61457 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccne1Q61457 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccne1Q61457 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccne1Q61457 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccne1Q61457 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccne1Q61457 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccne1Q61457 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccne1Q61457 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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