Protein–RNA interactions for Protein: Q61409

Pde3b, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, mousemouse

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Length 1,100 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde3bQ61409 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Pde3bQ61409 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pde3bQ61409 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pde3bQ61409 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pde3bQ61409 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Pde3bQ61409 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pde3bQ61409 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pde3bQ61409 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Pde3bQ61409 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Pde3bQ61409 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Pde3bQ61409 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pde3bQ61409 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Pde3bQ61409 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Pde3bQ61409 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Pde3bQ61409 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Pde3bQ61409 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Pde3bQ61409 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms