Protein–RNA interactions for Protein: Q61033

Tmpo, Lamina-associated polypeptide 2, isoforms alpha/zeta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TmpoQ61033 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TmpoQ61033 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms