Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Samhd1Q60710 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms