Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

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Length 189 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trp53i11Q4QQM4 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trp53i11Q4QQM4 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trp53i11Q4QQM4 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trp53i11Q4QQM4 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trp53i11Q4QQM4 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trp53i11Q4QQM4 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Trp53i11Q4QQM4 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trp53i11Q4QQM4 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trp53i11Q4QQM4 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trp53i11Q4QQM4 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trp53i11Q4QQM4 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trp53i11Q4QQM4 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
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Trp53i11Q4QQM4 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trp53i11Q4QQM4 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trp53i11Q4QQM4 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trp53i11Q4QQM4 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trp53i11Q4QQM4 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Trp53i11Q4QQM4 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Trp53i11Q4QQM4 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trp53i11Q4QQM4 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Trp53i11Q4QQM4 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trp53i11Q4QQM4 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Trp53i11Q4QQM4 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Trp53i11Q4QQM4 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Trp53i11Q4QQM4 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trp53i11Q4QQM4 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trp53i11Q4QQM4 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trp53i11Q4QQM4 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trp53i11Q4QQM4 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trp53i11Q4QQM4 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trp53i11Q4QQM4 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trp53i11Q4QQM4 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trp53i11Q4QQM4 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trp53i11Q4QQM4 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trp53i11Q4QQM4 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trp53i11Q4QQM4 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Trp53i11Q4QQM4 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trp53i11Q4QQM4 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trp53i11Q4QQM4 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trp53i11Q4QQM4 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trp53i11Q4QQM4 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trp53i11Q4QQM4 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trp53i11Q4QQM4 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trp53i11Q4QQM4 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
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