Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Gm28047Q3US59 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Gm28047Q3US59 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Gm28047Q3US59 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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