Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC8.3□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC8.3□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC8.3□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC8.3□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC8.3□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.3□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 173.2 ms