Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Skap2Q3UND0 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Skap2Q3UND0 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Skap2Q3UND0 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Skap2Q3UND0 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Skap2Q3UND0 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Skap2Q3UND0 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Skap2Q3UND0 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Skap2Q3UND0 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Skap2Q3UND0 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Skap2Q3UND0 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Skap2Q3UND0 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Skap2Q3UND0 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Skap2Q3UND0 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Skap2Q3UND0 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Skap2Q3UND0 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Skap2Q3UND0 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Skap2Q3UND0 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Skap2Q3UND0 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Skap2Q3UND0 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Skap2Q3UND0 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Skap2Q3UND0 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Skap2Q3UND0 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Skap2Q3UND0 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Skap2Q3UND0 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Skap2Q3UND0 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Skap2Q3UND0 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Skap2Q3UND0 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms