Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms