Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
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Nkx6-3Q3UHX8 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
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Nkx6-3Q3UHX8 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
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Nkx6-3Q3UHX8 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
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Nkx6-3Q3UHX8 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
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Nkx6-3Q3UHX8 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
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Nkx6-3Q3UHX8 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
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