Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q3U595 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q3U595 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q3U595 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Q3U595 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Q3U595 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Q3U595 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q3U595 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Q3U595 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Q3U595 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Q3U595 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q3U595 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q3U595 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Q3U595 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Q3U595 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q3U595 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q3U595 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q3U595 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q3U595 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q3U595 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q3U595 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q3U595 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q3U595 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q3U595 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q3U595 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Q3U595 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q3U595 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q3U595 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q3U595 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q3U595 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q3U595 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Q3U595 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Q3U595 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q3U595 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q3U595 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q3U595 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q3U595 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q3U595 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Q3U595 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q3U595 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q3U595 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q3U595 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q3U595 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q3U595 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q3U595 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q3U595 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q3U595 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q3U595 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q3U595 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q3U595 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q3U595 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Q3U595 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q3U595 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Q3U595 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q3U595 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q3U595 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Q3U595 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Q3U595 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q3U595 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Q3U595 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q3U595 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Q3U595 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q3U595 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q3U595 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q3U595 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q3U595 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q3U595 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q3U595 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q3U595 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q3U595 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q3U595 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q3U595 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q3U595 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q3U595 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q3U595 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q3U595 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q3U595 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q3U595 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q3U595 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q3U595 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q3U595 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q3U595 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q3U595 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q3U595 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Q3U595 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q3U595 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q3U595 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q3U595 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q3U595 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Q3U595 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q3U595 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q3U595 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q3U595 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q3U595 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q3U595 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q3U595 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Q3U595 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q3U595 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q3U595 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
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