Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf40Q3U319 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Rnf40Q3U319 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Rnf40Q3U319 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Rnf40Q3U319 Gm36941-202ENSMUST00000194799 621 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Rnf40Q3U319 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Cox20-201ENSMUST00000027781 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Rnf40Q3U319 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Gm42478-201ENSMUST00000199252 1467 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Gm39526-201ENSMUST00000208925 1413 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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