Protein–RNA interactions for Protein: Q3TR08

Fndc4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc4Q3TR08 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fndc4Q3TR08 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms