Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms