Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Sectm1a-201ENSMUST00000026162 1692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Rapgef4os2-201ENSMUST00000128165 2116 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 AC154171.3-201ENSMUST00000224519 2505 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Gm36814-201ENSMUST00000197457 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Nrbp2-201ENSMUST00000019516 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Gm43288-201ENSMUST00000197594 2628 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Gm37873-201ENSMUST00000194571 2280 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Slc22a13-201ENSMUST00000084797 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Zcchc12-202ENSMUST00000115256 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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