Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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