Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Gm5726-201ENSMUST00000173886 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Gm4214-201ENSMUST00000174451 960 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Gm8677-201ENSMUST00000174637 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Gm25025-201ENSMUST00000175018 111 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 1700029E06Rik-201ENSMUST00000189036 757 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Gm37533-201ENSMUST00000193848 545 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Olfr1447-201ENSMUST00000071484 1113 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Olfr1446-201ENSMUST00000081236 1044 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 mt-Nd3-201ENSMUST00000082411 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Bud31-206ENSMUST00000162308 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 4833421G17Rik-201ENSMUST00000191704 844 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Gm37002-201ENSMUST00000194560 373 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Gm43222-201ENSMUST00000199013 603 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Rpusd2Q149F1 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.4 ms