Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Atp2b3Q0VF55 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Atp2b3Q0VF55 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Atp2b3Q0VF55 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Atp2b3Q0VF55 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Atp2b3Q0VF55 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Atp2b3Q0VF55 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
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