Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Gm14616-201ENSMUST00000131690 314 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Ighv1-70-201ENSMUST00000196509 351 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Tspan32os-201ENSMUST00000131740 975 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Gm12052-201ENSMUST00000142151 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Cd300c2-201ENSMUST00000092464 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Gm20831-201ENSMUST00000177639 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Ssty1-202ENSMUST00000186035 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Gm20737-202ENSMUST00000187245 1338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Gm20777-202ENSMUST00000187434 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Gm20873-202ENSMUST00000187857 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Gm20772-201ENSMUST00000188928 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Gm21310-202ENSMUST00000189630 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Gm20795-202ENSMUST00000190909 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Gm21454-202ENSMUST00000192204 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Gm21440-201ENSMUST00000192749 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Gm20831-202ENSMUST00000194411 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Gm20807-201ENSMUST00000194687 1336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Gm21425-202ENSMUST00000195626 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Tmem181c-ps-201ENSMUST00000115772 1288 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Mir432-201ENSMUST00000157230 75 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Map1lc3b-205ENSMUST00000181948 766 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Kif4-ps-202ENSMUST00000185083 652 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 AC162938.2-202ENSMUST00000215497 722 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Gm12668-201ENSMUST00000134966 575 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Gm37851-201ENSMUST00000193871 889 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 AC117769.1-201ENSMUST00000224716 1120 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Pex5l-203ENSMUST00000108221 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Gm28356-201ENSMUST00000186941 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Gm43777-201ENSMUST00000197269 376 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Stxbp4-203ENSMUST00000107875 1660 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TrioQ0KL02 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms