Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc4Q08624 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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