Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
NrepQ07475 N6amt1-204ENSMUST00000120284 3473 ntTSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Erc2-205ENSMUST00000210135 6233 ntTSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Meox2-201ENSMUST00000041183 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Bace1-202ENSMUST00000078111 4041 ntTSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Oprm1-230ENSMUST00000154906 2039 ntTSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
NrepQ07475 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC8.19□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.19□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC8.19□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC8.19□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC8.19□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC8.19□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Glt1d1-201ENSMUST00000118139 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
NrepQ07475 4933407K13Rik-203ENSMUST00000138943 4364 ntTSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Dysf-203ENSMUST00000113818 6571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Shank2-201ENSMUST00000097929 4418 ntTSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Gm43112-201ENSMUST00000196665 3122 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Ank1-206ENSMUST00000117662 6257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Gm6714-201ENSMUST00000218677 2330 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC8.19□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Pde2a-201ENSMUST00000163751 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Gm26751-201ENSMUST00000181218 4245 ntTSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Arid5b-204ENSMUST00000219238 7581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Hcfc1-201ENSMUST00000033761 8138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Pcdh15-226ENSMUST00000151116 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Gm43517-201ENSMUST00000110746 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.19□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Cacna1d-207ENSMUST00000224198 6564 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.19□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Sulf2-202ENSMUST00000109249 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Nav2-216ENSMUST00000184945 10665 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Pax3-201ENSMUST00000004994 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Dnm3-201ENSMUST00000070330 4601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
NrepQ07475 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Itgam-207ENSMUST00000098015 4803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Gm10465-201ENSMUST00000223133 3334 ntTSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
NrepQ07475 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Fam184b-201ENSMUST00000016023 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.18□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC8.18□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
NrepQ07475 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms