Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
AmbpQ07456 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
AmbpQ07456 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
AmbpQ07456 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
AmbpQ07456 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
AmbpQ07456 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
AmbpQ07456 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
AmbpQ07456 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
AmbpQ07456 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
AmbpQ07456 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
AmbpQ07456 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
AmbpQ07456 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
AmbpQ07456 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
AmbpQ07456 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
AmbpQ07456 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
AmbpQ07456 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
AmbpQ07456 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
AmbpQ07456 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
AmbpQ07456 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
AmbpQ07456 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
AmbpQ07456 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
AmbpQ07456 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
AmbpQ07456 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
AmbpQ07456 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
AmbpQ07456 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
AmbpQ07456 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
AmbpQ07456 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
AmbpQ07456 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
AmbpQ07456 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
AmbpQ07456 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
AmbpQ07456 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
AmbpQ07456 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
AmbpQ07456 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
AmbpQ07456 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
AmbpQ07456 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
AmbpQ07456 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
AmbpQ07456 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
AmbpQ07456 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
AmbpQ07456 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
AmbpQ07456 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
AmbpQ07456 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
AmbpQ07456 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
AmbpQ07456 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
AmbpQ07456 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
AmbpQ07456 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
AmbpQ07456 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
AmbpQ07456 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
AmbpQ07456 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
AmbpQ07456 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
AmbpQ07456 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
AmbpQ07456 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
AmbpQ07456 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
AmbpQ07456 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
AmbpQ07456 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
AmbpQ07456 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
AmbpQ07456 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
AmbpQ07456 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
AmbpQ07456 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
AmbpQ07456 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
AmbpQ07456 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
AmbpQ07456 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
AmbpQ07456 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
AmbpQ07456 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
AmbpQ07456 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
AmbpQ07456 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
AmbpQ07456 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
AmbpQ07456 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
AmbpQ07456 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
AmbpQ07456 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
AmbpQ07456 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
AmbpQ07456 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
AmbpQ07456 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
AmbpQ07456 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
AmbpQ07456 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
AmbpQ07456 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
AmbpQ07456 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
AmbpQ07456 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
AmbpQ07456 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
AmbpQ07456 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
AmbpQ07456 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
AmbpQ07456 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
AmbpQ07456 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
AmbpQ07456 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
AmbpQ07456 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
AmbpQ07456 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
AmbpQ07456 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
AmbpQ07456 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
AmbpQ07456 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
AmbpQ07456 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
AmbpQ07456 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
AmbpQ07456 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
AmbpQ07456 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
AmbpQ07456 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
AmbpQ07456 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
AmbpQ07456 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
AmbpQ07456 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
AmbpQ07456 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
AmbpQ07456 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
AmbpQ07456 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
AmbpQ07456 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms