Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms