Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NfiaQ02780 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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