Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pax5Q02650 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms