Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC10.58□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Ascl1Q02067 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ascl1Q02067 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ascl1Q02067 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ascl1Q02067 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ascl1Q02067 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ascl1Q02067 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ascl1Q02067 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ascl1Q02067 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ascl1Q02067 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ascl1Q02067 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ascl1Q02067 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ascl1Q02067 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ascl1Q02067 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ascl1Q02067 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ascl1Q02067 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ascl1Q02067 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ascl1Q02067 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ascl1Q02067 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ascl1Q02067 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ascl1Q02067 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ascl1Q02067 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ascl1Q02067 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ascl1Q02067 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ascl1Q02067 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ascl1Q02067 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ascl1Q02067 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ascl1Q02067 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ascl1Q02067 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ascl1Q02067 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ascl1Q02067 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ascl1Q02067 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ascl1Q02067 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ascl1Q02067 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ascl1Q02067 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ascl1Q02067 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ascl1Q02067 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ascl1Q02067 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ascl1Q02067 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ascl1Q02067 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ascl1Q02067 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ascl1Q02067 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ascl1Q02067 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ascl1Q02067 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ascl1Q02067 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ascl1Q02067 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ascl1Q02067 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ascl1Q02067 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ascl1Q02067 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ascl1Q02067 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ascl1Q02067 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ascl1Q02067 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ascl1Q02067 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ascl1Q02067 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ascl1Q02067 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ascl1Q02067 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ascl1Q02067 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ascl1Q02067 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ascl1Q02067 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ascl1Q02067 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ascl1Q02067 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ascl1Q02067 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ascl1Q02067 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ascl1Q02067 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ascl1Q02067 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ascl1Q02067 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ascl1Q02067 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ascl1Q02067 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ascl1Q02067 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ascl1Q02067 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ascl1Q02067 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ascl1Q02067 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ascl1Q02067 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ascl1Q02067 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ascl1Q02067 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ascl1Q02067 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ascl1Q02067 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ascl1Q02067 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ascl1Q02067 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ascl1Q02067 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ascl1Q02067 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ascl1Q02067 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ascl1Q02067 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ascl1Q02067 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ascl1Q02067 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ascl1Q02067 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ascl1Q02067 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ascl1Q02067 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms