Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cacna1cQ01815 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.9 ms