Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms