Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Nps-202ENSMUST00000210697 1082 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EgfrQ01279 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms