Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Col1a2Q01149 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col1a2Q01149 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col1a2Q01149 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Col1a2Q01149 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Col1a2Q01149 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Col1a2Q01149 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Col1a2Q01149 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Col1a2Q01149 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col1a2Q01149 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Col1a2Q01149 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Col1a2Q01149 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col1a2Q01149 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col1a2Q01149 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col1a2Q01149 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col1a2Q01149 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col1a2Q01149 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col1a2Q01149 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Col1a2Q01149 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col1a2Q01149 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col1a2Q01149 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col1a2Q01149 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col1a2Q01149 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col1a2Q01149 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Col1a2Q01149 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Col1a2Q01149 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Col1a2Q01149 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col1a2Q01149 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Col1a2Q01149 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col1a2Q01149 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Col1a2Q01149 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Col1a2Q01149 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col1a2Q01149 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col1a2Q01149 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col1a2Q01149 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col1a2Q01149 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Col1a2Q01149 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col1a2Q01149 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Col1a2Q01149 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Col1a2Q01149 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Col1a2Q01149 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col1a2Q01149 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col1a2Q01149 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Col1a2Q01149 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col1a2Q01149 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col1a2Q01149 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col1a2Q01149 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col1a2Q01149 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col1a2Q01149 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col1a2Q01149 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col1a2Q01149 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Col1a2Q01149 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col1a2Q01149 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col1a2Q01149 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col1a2Q01149 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Col1a2Q01149 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col1a2Q01149 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Col1a2Q01149 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col1a2Q01149 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Col1a2Q01149 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col1a2Q01149 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Col1a2Q01149 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col1a2Q01149 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Col1a2Q01149 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col1a2Q01149 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Col1a2Q01149 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Col1a2Q01149 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Col1a2Q01149 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col1a2Q01149 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col1a2Q01149 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Col1a2Q01149 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Col1a2Q01149 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Col1a2Q01149 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Col1a2Q01149 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Col1a2Q01149 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col1a2Q01149 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col1a2Q01149 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Col1a2Q01149 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col1a2Q01149 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Col1a2Q01149 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Col1a2Q01149 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Col1a2Q01149 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col1a2Q01149 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col1a2Q01149 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col1a2Q01149 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Col1a2Q01149 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Col1a2Q01149 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col1a2Q01149 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col1a2Q01149 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col1a2Q01149 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Col1a2Q01149 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Col1a2Q01149 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col1a2Q01149 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col1a2Q01149 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Col1a2Q01149 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Col1a2Q01149 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col1a2Q01149 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col1a2Q01149 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Col1a2Q01149 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col1a2Q01149 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86 ms