Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 BC106175-201ENSMUST00000218578 695 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Arhgef33-207ENSMUST00000224966 490 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Gm25998-201ENSMUST00000175397 53 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Gm12681-201ENSMUST00000132337 700 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Grin2bQ01097 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.8 ms