Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pde1bQ01065 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Pde1bQ01065 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pde1bQ01065 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pde1bQ01065 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pde1bQ01065 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pde1bQ01065 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pde1bQ01065 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pde1bQ01065 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pde1bQ01065 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pde1bQ01065 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pde1bQ01065 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pde1bQ01065 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pde1bQ01065 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pde1bQ01065 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pde1bQ01065 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pde1bQ01065 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pde1bQ01065 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pde1bQ01065 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pde1bQ01065 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pde1bQ01065 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pde1bQ01065 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pde1bQ01065 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pde1bQ01065 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pde1bQ01065 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pde1bQ01065 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pde1bQ01065 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pde1bQ01065 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pde1bQ01065 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pde1bQ01065 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pde1bQ01065 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pde1bQ01065 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pde1bQ01065 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pde1bQ01065 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pde1bQ01065 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pde1bQ01065 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Pde1bQ01065 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Pde1bQ01065 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Pde1bQ01065 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Pde1bQ01065 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pde1bQ01065 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pde1bQ01065 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Pde1bQ01065 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pde1bQ01065 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Pde1bQ01065 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pde1bQ01065 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Pde1bQ01065 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Pde1bQ01065 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Pde1bQ01065 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Pde1bQ01065 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Pde1bQ01065 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Pde1bQ01065 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pde1bQ01065 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pde1bQ01065 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pde1bQ01065 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Pde1bQ01065 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pde1bQ01065 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pde1bQ01065 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Pde1bQ01065 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pde1bQ01065 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
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Pde1bQ01065 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Pde1bQ01065 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pde1bQ01065 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Pde1bQ01065 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pde1bQ01065 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pde1bQ01065 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pde1bQ01065 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pde1bQ01065 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pde1bQ01065 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pde1bQ01065 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pde1bQ01065 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pde1bQ01065 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pde1bQ01065 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pde1bQ01065 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pde1bQ01065 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pde1bQ01065 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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