Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
PrcdQ00LT2 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC8.52□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC8.52□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC8.51□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms