Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbp1Q00915 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbp1Q00915 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbp1Q00915 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbp1Q00915 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbp1Q00915 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbp1Q00915 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbp1Q00915 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbp1Q00915 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbp1Q00915 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbp1Q00915 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbp1Q00915 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbp1Q00915 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbp1Q00915 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbp1Q00915 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbp1Q00915 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbp1Q00915 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbp1Q00915 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbp1Q00915 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbp1Q00915 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbp1Q00915 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbp1Q00915 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbp1Q00915 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbp1Q00915 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbp1Q00915 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbp1Q00915 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbp1Q00915 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbp1Q00915 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbp1Q00915 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbp1Q00915 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbp1Q00915 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbp1Q00915 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbp1Q00915 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbp1Q00915 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbp1Q00915 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbp1Q00915 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbp1Q00915 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbp1Q00915 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbp1Q00915 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbp1Q00915 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbp1Q00915 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbp1Q00915 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbp1Q00915 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbp1Q00915 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbp1Q00915 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbp1Q00915 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbp1Q00915 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbp1Q00915 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbp1Q00915 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp1Q00915 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp1Q00915 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp1Q00915 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp1Q00915 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp1Q00915 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp1Q00915 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp1Q00915 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp1Q00915 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp1Q00915 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp1Q00915 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp1Q00915 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp1Q00915 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp1Q00915 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp1Q00915 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp1Q00915 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp1Q00915 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp1Q00915 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp1Q00915 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp1Q00915 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp1Q00915 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp1Q00915 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp1Q00915 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp1Q00915 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp1Q00915 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp1Q00915 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp1Q00915 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp1Q00915 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp1Q00915 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp1Q00915 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp1Q00915 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp1Q00915 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp1Q00915 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp1Q00915 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp1Q00915 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp1Q00915 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp1Q00915 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp1Q00915 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp1Q00915 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp1Q00915 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp1Q00915 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp1Q00915 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp1Q00915 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp1Q00915 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp1Q00915 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp1Q00915 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp1Q00915 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbp1Q00915 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbp1Q00915 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbp1Q00915 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbp1Q00915 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbp1Q00915 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.8 ms