Protein–RNA interactions for Protein: P98191

Cds1, Phosphatidate cytidylyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cds1P98191 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cds1P98191 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cds1P98191 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cds1P98191 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cds1P98191 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cds1P98191 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cds1P98191 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cds1P98191 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cds1P98191 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cds1P98191 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cds1P98191 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cds1P98191 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cds1P98191 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cds1P98191 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cds1P98191 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cds1P98191 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cds1P98191 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cds1P98191 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cds1P98191 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cds1P98191 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cds1P98191 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cds1P98191 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cds1P98191 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cds1P98191 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cds1P98191 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cds1P98191 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cds1P98191 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cds1P98191 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cds1P98191 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cds1P98191 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cds1P98191 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cds1P98191 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cds1P98191 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cds1P98191 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cds1P98191 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cds1P98191 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cds1P98191 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cds1P98191 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cds1P98191 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cds1P98191 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cds1P98191 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cds1P98191 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cds1P98191 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cds1P98191 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cds1P98191 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cds1P98191 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cds1P98191 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cds1P98191 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cds1P98191 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cds1P98191 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cds1P98191 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cds1P98191 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cds1P98191 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cds1P98191 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cds1P98191 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cds1P98191 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cds1P98191 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cds1P98191 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cds1P98191 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cds1P98191 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cds1P98191 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cds1P98191 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cds1P98191 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cds1P98191 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cds1P98191 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cds1P98191 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cds1P98191 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cds1P98191 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cds1P98191 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cds1P98191 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cds1P98191 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cds1P98191 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cds1P98191 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cds1P98191 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cds1P98191 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cds1P98191 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cds1P98191 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cds1P98191 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cds1P98191 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cds1P98191 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cds1P98191 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cds1P98191 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cds1P98191 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cds1P98191 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cds1P98191 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cds1P98191 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cds1P98191 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cds1P98191 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cds1P98191 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cds1P98191 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cds1P98191 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cds1P98191 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cds1P98191 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cds1P98191 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cds1P98191 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cds1P98191 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cds1P98191 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cds1P98191 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cds1P98191 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cds1P98191 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms