Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Irx1P81068 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Irx1P81068 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Irx1P81068 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Irx1P81068 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Irx1P81068 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Irx1P81068 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Irx1P81068 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Irx1P81068 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Irx1P81068 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Irx1P81068 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Irx1P81068 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Irx1P81068 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
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