Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

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Length 355 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Otx1P80205 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Otx1P80205 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Otx1P80205 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Otx1P80205 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Otx1P80205 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Otx1P80205 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Otx1P80205 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Otx1P80205 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Otx1P80205 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Otx1P80205 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Otx1P80205 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Otx1P80205 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
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