Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Chl1P70232 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Chl1P70232 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Chl1P70232 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chl1P70232 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chl1P70232 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chl1P70232 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chl1P70232 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Chl1P70232 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chl1P70232 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chl1P70232 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chl1P70232 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chl1P70232 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chl1P70232 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chl1P70232 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chl1P70232 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chl1P70232 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chl1P70232 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chl1P70232 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chl1P70232 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chl1P70232 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Chl1P70232 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chl1P70232 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Chl1P70232 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Chl1P70232 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Chl1P70232 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Chl1P70232 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Chl1P70232 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Chl1P70232 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC15.04■□□□□ -0
Chl1P70232 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chl1P70232 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chl1P70232 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Chl1P70232 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Chl1P70232 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chl1P70232 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chl1P70232 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chl1P70232 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Chl1P70232 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chl1P70232 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chl1P70232 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Chl1P70232 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chl1P70232 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Chl1P70232 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Chl1P70232 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Chl1P70232 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Chl1P70232 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chl1P70232 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chl1P70232 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chl1P70232 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Chl1P70232 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Chl1P70232 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chl1P70232 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Chl1P70232 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Chl1P70232 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Chl1P70232 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chl1P70232 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chl1P70232 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Chl1P70232 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Chl1P70232 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chl1P70232 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Chl1P70232 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Chl1P70232 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Chl1P70232 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Chl1P70232 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chl1P70232 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chl1P70232 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chl1P70232 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chl1P70232 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chl1P70232 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chl1P70232 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chl1P70232 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chl1P70232 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Chl1P70232 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chl1P70232 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Chl1P70232 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chl1P70232 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chl1P70232 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Chl1P70232 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Chl1P70232 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Chl1P70232 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Chl1P70232 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Chl1P70232 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Chl1P70232 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Chl1P70232 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Chl1P70232 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Chl1P70232 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Chl1P70232 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Chl1P70232 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Chl1P70232 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Chl1P70232 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Chl1P70232 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Chl1P70232 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Chl1P70232 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Chl1P70232 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Chl1P70232 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Chl1P70232 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Chl1P70232 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Chl1P70232 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Chl1P70232 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Chl1P70232 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms