Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrig1P70193 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrig1P70193 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrig1P70193 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrig1P70193 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrig1P70193 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrig1P70193 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrig1P70193 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrig1P70193 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrig1P70193 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrig1P70193 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrig1P70193 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrig1P70193 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrig1P70193 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrig1P70193 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrig1P70193 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrig1P70193 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrig1P70193 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrig1P70193 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrig1P70193 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrig1P70193 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrig1P70193 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrig1P70193 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrig1P70193 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrig1P70193 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrig1P70193 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrig1P70193 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrig1P70193 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrig1P70193 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrig1P70193 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrig1P70193 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrig1P70193 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrig1P70193 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrig1P70193 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrig1P70193 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrig1P70193 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrig1P70193 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrig1P70193 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrig1P70193 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrig1P70193 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrig1P70193 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrig1P70193 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrig1P70193 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrig1P70193 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrig1P70193 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrig1P70193 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrig1P70193 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrig1P70193 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrig1P70193 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrig1P70193 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrig1P70193 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrig1P70193 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrig1P70193 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrig1P70193 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrig1P70193 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrig1P70193 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrig1P70193 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrig1P70193 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrig1P70193 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrig1P70193 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrig1P70193 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrig1P70193 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrig1P70193 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrig1P70193 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrig1P70193 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrig1P70193 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrig1P70193 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrig1P70193 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrig1P70193 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrig1P70193 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrig1P70193 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrig1P70193 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrig1P70193 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrig1P70193 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrig1P70193 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrig1P70193 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrig1P70193 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrig1P70193 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrig1P70193 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrig1P70193 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrig1P70193 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrig1P70193 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrig1P70193 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrig1P70193 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrig1P70193 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrig1P70193 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrig1P70193 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrig1P70193 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrig1P70193 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrig1P70193 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrig1P70193 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrig1P70193 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrig1P70193 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrig1P70193 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrig1P70193 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrig1P70193 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Lrig1P70193 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lrig1P70193 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lrig1P70193 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lrig1P70193 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms