Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab3cP62823 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1100.7 ms