Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp46P62069 4930518I15Rik-201ENSMUST00000099141 1331 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp46P62069 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Smim8-205ENSMUST00000108134 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Usp46P62069 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Usp46P62069 Cnot2-201ENSMUST00000020374 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Usp46P62069 AC165256.1-201ENSMUST00000216687 670 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Usp46P62069 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp46P62069 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Usp46P62069 Olfr1480-201ENSMUST00000072219 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Usp46P62069 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Usp46P62069 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Usp46P62069 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp46P62069 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Usp46P62069 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Usp46P62069 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp46P62069 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp46P62069 AC158388.1-201ENSMUST00000225441 256 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp46P62069 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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