Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P58686 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P58686 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P58686 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P58686 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P58686 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P58686 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P58686 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P58686 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P58686 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P58686 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P58686 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P58686 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P58686 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P58686 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P58686 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P58686 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P58686 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P58686 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P58686 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P58686 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P58686 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P58686 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P58686 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P58686 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P58686 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P58686 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P58686 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P58686 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P58686 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P58686 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P58686 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P58686 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P58686 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P58686 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P58686 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P58686 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P58686 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P58686 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P58686 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P58686 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P58686 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P58686 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P58686 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P58686 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P58686 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P58686 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P58686 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P58686 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P58686 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P58686 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P58686 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P58686 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P58686 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P58686 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P58686 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P58686 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P58686 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P58686 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P58686 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P58686 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P58686 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P58686 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P58686 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P58686 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P58686 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P58686 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P58686 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P58686 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P58686 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P58686 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P58686 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P58686 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P58686 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P58686 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P58686 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P58686 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P58686 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P58686 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P58686 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
P58686 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P58686 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P58686 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P58686 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
P58686 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
P58686 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P58686 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
P58686 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
P58686 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P58686 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P58686 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P58686 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P58686 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P58686 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P58686 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P58686 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P58686 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P58686 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P58686 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P58686 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms