Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp25P57080 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp25P57080 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp25P57080 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Usp25P57080 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp25P57080 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp25P57080 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Usp25P57080 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp25P57080 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp25P57080 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp25P57080 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp25P57080 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Usp25P57080 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp25P57080 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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