Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Aebp1-202ENSMUST00000109829 2541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Sh3bp1P55194 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms