Protein–RNA interactions for Protein: P52795

Efnb1, Ephrin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb1P52795 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms