Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
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PtpreP49446 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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PtpreP49446 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtpreP49446 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
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PtpreP49446 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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PtpreP49446 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtpreP49446 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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PtpreP49446 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
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PtpreP49446 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
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PtpreP49446 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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PtpreP49446 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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PtpreP49446 Rpa3-201ENSMUST00000012627 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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PtpreP49446 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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PtpreP49446 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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PtpreP49446 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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PtpreP49446 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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PtpreP49446 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtpreP49446 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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PtpreP49446 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
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PtpreP49446 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Gm37002-201ENSMUST00000194560 373 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtpreP49446 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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PtpreP49446 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PtpreP49446 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PtpreP49446 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Ndufc1-201ENSMUST00000038108 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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